Chepo, el único DT exitoso en la era Vergara

Siete años tuvieron que pasar para que José Manuel 'Chepo' de la Torre regresara a Chivas, equipo al que hizo campeón y llevó hasta Semifinales de la Copa Libertadores.

En su primera etapa, De la Torre asumió el timón del equipo en la jornada 11 el Clausura 2006, como reemplazo del holandés Hans Westerhof. Chepo llegó hasta las Semifinales de la Liguilla, donde cayó con Pachuca, equipo que a la postre sería el monarca.

En ese año, el equipo tapatío también disputa la Copa Libertadores, pero su sueño terminó en Semifinales tras caer contra Sao Paulo.

Para el Apertura 2006 se dio el anhelado título. Pese a que ingresó a la Liguilla como octavo lugar, el conjunto rojiblanco fue superando rivales hasta la Final, instancia en la que doblegó al Toluca en el Nemesio Díez.

Durante la era Chepo, Chivas fue base de la Selección Mexicana con jugadores como Oswaldo Sánchez, Carlos Salcido, Francisco Javier Rodríguez, Gonzalo Pineda, Ramón Morales y Omar Bravo, quienes de hecho fueron mundialistas en Alemania 2006.

En el Clausura 2007, el Rebaño Sagrado ingresó a la 'Fiesta Grande', sin embargo, sufrió una dolorosa eliminación en la antesala por el título a manos de las Águilas del América. La era De la Torre concluyó el siguiente torneo, luego de la derrota por 1-0 contra Toluca en la jornada 9.