Paunovic llegó a Chivas para el Clausura 2023, donde logró llevar al equipo de Jalisco a la Final del torneo y estuvo a 45 minutos de poder levantar el trofeo, desafortunadamente no pudieron mantener la ventaja en casa.
Para su segundo torneo, el DT logró mantener al rebaño dentro de los 5 mejores equipos en la temporada regular, sin embargo, terminaron eliminados en Cuartos de Final al caer 3-1 ante Pumas.
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